En Belgique et en Autriche, les étudiants étrangers ne sont pas si libres de circuler que cela. Depuis juin 2006, le Parlement de la communauté francophone de Belgique a adopté un décret introduisant un quota de 70 % réservé aux étudiants belges ou ayant leur résidence dans le royaume pour un certain nombre de disciplines médicales. Malgré une condamnation de la Cour de justice européenne de juillet 2005, l'Autriche, elle, a maintenu ses quotas discriminatoires contre les autres étudiants des États membres. 75 % des places en médecine et en dentaire demeurent réservées aux étudiants autrichiens jusqu'à la fin 2007. Deux positions qui se sont attiré les foudres de Bruxelles. La Commission a ouvert fin janvier une procédure d'infraction à l'encontre de la Belgique et de l'Autriche par le biais de lettres de mise en demeure. Les deux États ont jusqu'à fin mars pour répondre. Sans justification de leur part, c'est la Cour de justice européenne qui pourrait prendre le relais. En Belgique, la Fédération des étudiant(e)s francophones de Belgique (FEF) a dénoncé une « violation au principe de libre circulation des étudiants ».

Pour autant, le débat fait rage dans les deux pays. En pratique, ce sont surtout les étudiants allemands qui sont lésés en Autriche. En Belgique, ce sont les Français. Ces derniers représentent 86 % des étudiants en médecine vétérinaire. Ils dépassent également les 80 % en kinésithérapie ou en audiologie. Mais, une fois leur diplôme en poche, ces étudiants rentrent massivement au bercail, laissant la Belgique face à une pénurie de main-d'œuvre !